少年三国志2游戏本身是支持玩家进行阵容调整的，这一基础功能允许玩家自由更换和调配已拥有的上阵武将。具体的操作路径是，玩家可以在游戏主界面的下方找到阵容入口，点击进入个人英雄面板后，再选择布阵功能，即可进入阵容调整的界面。在该界面中，玩家可以通过直接拖拽武将头像到不同的出战位置上，从而完成对当前作战阵容的更换，系统会根据新的站位自动调整攻击顺序，调整完毕后退出界面即可生效。
关于改变玩家在游戏初期所选定的国家阵营，其规则则相对复杂。游戏的主玩法在初始选择魏、蜀、吴、群雄四大阵营后，通常是不允许直接免费切换的。但游戏机制也并非完全封闭，当玩家确有需要时，可以通过消耗特定资源来实现阵营的转换。主要途径是在游戏的商城中，使用一定数量的元宝购买名为阵营转换卡的特殊道具，使用该道具后，玩家便可以将自己的主力阵容转换为另一个心仪的阵营。这一设定为玩家的长期发展提供了策略调整的空间，但因其需要消耗珍贵的元宝资源，故不建议频繁进行更换。
除了主玩法的阵营可以付费转换外，游戏内的一些特定活动或赛季玩法，也存在独立的阵营选择与转换机制。例如在逐鹿天下相关的赛季玩法中，可能会引入临时的阵营对抗模式。在这种模式下，通常围绕特定主题划分阵营，玩家可以遵循活动规则，在赛季开始前的预热阶段，以军团为单位进行阵营选择，且在预热期内允许进行切换。一旦该赛季玩法正式开启，所选择的阵营在整个赛季周期内将被锁定，无法再次更改。这体现了游戏在不同模式下，对于阵营自由度有着差异化的设计。
无论是调整阵容还是转换阵营，都需要玩家进行审慎的规划。对于阵容调整，这是日常性的战术行为，玩家可以根据关卡特性或对手特点灵活变阵。而对于涉及资源消耗的阵营转换，则属于战略层面的决策。因为转换阵营不仅意味着需要重新构建一套符合新阵营羁绊的武将体系，还涉及到将魂、装备、神兵等大量养成资源的重新分配，会经历一段战力整合与提升的过渡期。玩家在进行此类操作前，需要充分评估自身的资源储备、目标阵营的武将养成进度以及可能面临的短期战力波动，确保转换的收益大于所付出的成本。
